نخبة من الأقسام التخصصية التي تغطي كافة جوانب أبحاث المياه
دراسة حركة المياه السطحية الناتجة عن الأمطار والسيول، وتحليل خصائص أحواض التصريف، وتقييم مخاطر الفيضانات، بما يدعم التخطيط السليم للمشروعات وحماية الأرواح والمنشآت وتحقيق الإدارة المستدامة للموارد المائية.
لإجراء أبحاث رائدة في مجال الهيدرولوجيا، وتأثيرات المناخ، وإدارة موارد المياه في أعالي نهر النيل.
ودراسة إمكانات حصاد مياه الأمطار والسيول وتغذية الخزانات الجوفية، بما يسهم في تحقيق الإدارة المتكاملة والمستدامة
دراسة المياه الجوفية حيث يقوم قسم الهيدروجيولوجيا والجيوفيزياء بـ دراسة واستكشاف خزان المياه الجوفية والطبقات السطحية والتحت سطحية باستخدام التقنيات المساحية الحديثة كالقياسات الجيوفيزيائية الكهربائية والرادارية (GPR). يعمل القسم على تقييم الإنتاجية ونوعية المياه وتحديد أفضل المواقع للآبار